белок-белковые взаимодействия, аффинность связывания, коронавирус, rbd-ace2, биоинформатика, protein-protein interactions, binding affinity, coronavirus, bioinformatics, Genetics, QH426-470

Методы, разрабатываемые для определения аффинности, имеют как и прикладное значение при поиске и разработке новых лекарств, так и значение для фундаментальной биофизики – поиск основных паттернов взаимодействия и автоматизированное описание систем интерфейсов белковых структур. В данной работе произведена оценка экспериментально полученных структур 30 комплексов рецептора ACE2 (Ангиотензинпревращающий фермент 2) с RDB (S-белок мутантного и дикого типа коронавирусов SARS-CoV и SARS-CoV-2, включая многочисленные мутантные формы последнего). Также проведен детальный структурный анализ, выявлены статистически значимые основные структурные элементы, вносящие высокий вклад в аффинность для комплексов с сильным связыванием (Kd < 30 nM). Полученная модель позволяет по-новому взглянуть на присутствие и вклад отдельных атомных групп в аффинность.